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WordPressの[ショートコード]は、基本的には投稿や固定ページの編集画面で埋め込んで使います。
しかし、簡単なコードを利用することで[header.php]や[sidebar.php]、または「page.php」などのテーマファイル内でも機能するようになります。

以下の書式でテーマファイルの任意の場所に記述すればOK。

<?php echo do_shortcode('[ショートコード]'); ?>

このテクニック、けっこう知らない方が多いようです。
便利なのでぜひ覚えておいてください。